支气管镜检查不能有效排除肺结核。支气管镜主要用于支气管结核、淋巴结、支气管瘘的诊断。支气管结核可见粘膜充血、溃疡、糜烂、组织增生、瘢痕形成，及支气管狭窄表现。可以在病灶处钳取活体组织，行病理学检查和结核菌培养。

对于肺内病灶可以采集分泌物、冲洗液做病原体检查，还可经支气管镜行肺活检获取标本检查。支气管镜检查只能看到支气管内，及下级分支气管内情况，对远端、外周的病灶是不能看到的。

肺结核的排除需要结合症状体征、影像学检查、痰结核菌检查，及结核菌素试验等综合判断，不能只依靠支气管镜排外肺结核。