胆管肿瘤绝大部分为恶性肿瘤，早期症状不太明显，患者很少出现腹部疼痛。

而胆管结石是良性疾病，大多数患者平时会有上腹部不适或者胃痛的症状，一般胆管炎急性发作时会出现剧烈腹痛、寒战、高热和黄疸等现象。而且胆管肿瘤是胆管本身良性或者恶性的病变，是胆管细胞或者胆管内壁引起的胆管的一种占位性的改变。

胆管结石是一种外来的或者后天逐渐形成的结石沉积引起的，是完全不同的两种疾病。但是有时这两种疾病也是可以共存的，有时结石只是肿瘤的一个继发病变。