月经第五天可以做B超检查。一般只要不是在月经量多的时间做阴道B超，其他时间做B超检查都是可以的。尤其是腹部B超，并没有辐射，任何时间做检查都不会对月经造成影响，并不会导致月经量过多，或者月经时间延长。

如果是要做卵巢储备的检查，做窦卵泡数目的检查，一般也是要在这个时间尽早一些检查。

如果有异常出血的问题，月经第五天持续出血量大，有可能造成贫血，或者伴有腹痛等情况。都是可以随时做检查的，要做随时的处理治疗。