患有卵巢囊肿可以通过以下方式进行处理：

1.相关检查。当女性患上卵巢囊肿时，应该及时去当地医院进行B超检查，根据B超检测结果，在医生嘱咐下给予相应药物，或者是其他方式达到治疗的目的。

2.口服药物。对于症状较轻的卵巢囊肿，其实卵巢状态并不是特别大，而且身体也没有明显的不适或者是异样，这时候只要在医生嘱咐下口服短效避孕药就可达到治疗效果。

3.手术治疗。对于症状较为严重的，并且囊肿体积较大，还伴随一些下腹不适和坠胀感，就需要立即通过手术的方式达到治疗目的。