耳朵内隐隐作痛，可能有以下原因：

1.有可能与患有慢性外耳道炎、中耳炎、鼓膜炎等相关的疾病有关系。上述疾病如果不是急性发作期，可能会出现隐隐作痛的表现。临床上进行抗炎等相关治疗，局部炎症减轻了之后，这种表现可能会有减轻。

2.有可能与患有耳道耵聍或者异物堵塞耳道有关系。尤其当局部伴有感染的时候，比如洗澡耳朵进水了，可能会出现隐隐作痛的表现。

3.不能排除耳道内长新生物的可能。比如有耳道胆脂瘤、耳道肉芽肿、耳道骨瘤等相关的疾病，都有可能出现隐隐作痛的表现，与局部肿物增大、压迫耳道壁可能有关系。