导致下肚子隐隐作痛的原因有很多，妇科的炎症性疾病可能导致小肚子隐隐作痛，如急慢性宫颈炎、子宫内膜炎、附件炎、盆腔炎等。

子宫内膜异位症、巧克力囊肿、子宫腺肌症等都可以引起下肚子隐隐作痛。另外，着凉或者痛经也会导致下肚子隐隐作痛。

导致下肚子隐隐作痛的原因，还有可能是消化系统疾病导致的，比如慢性肠炎、肠胀气、长期便秘等都可以导致肚子隐隐作痛。泌尿系统的炎症以及结石也会导致下腹隐隐作痛，比如慢性膀胱炎、泌尿系统泥沙样结石。