典型的肾结核通过做CT可以确诊，但是对于早期、不典型的肾结核CT检查也不能确定病情。

诊断肾结核往往是需要综合分析，比如要结合患者病史，还要结合实验室检查和影像学的检查一起判断，比如常规要做尿常规、尿抗酸杆菌、尿结核杆菌培养等。通过CT检查可以发现肾盂、肾盏和输尿管的结构发生改变，可以发现是否有钙化、集合系统是否有空洞、肾脏是否有功能、肾盂和输尿管壁是否有纤维化的增厚，如果有这些改变，就支持肾结核。

肾脏CT还可以看到肾脏实质的厚度，反应结核破坏的程度。通过CT检查有助于肾结核与肾脏肿瘤鉴别，一般肾结核是无需CT检查，但CT检查有助于排除其它疾病。