卵巢囊肿治疗后会不会复发，和治疗的方式并没有特别的相关性，因为卵巢囊肿的发生和发展，主要是和先天因素有关。

也有的卵巢囊肿是和女性体内的激素水平不平稳有关系，有的只是生理性的，是可以自动消失，而不需要积极手术治疗的。

也有的卵巢囊肿是属于雌激素依赖性疾病，比如卵巢巧克力囊肿，这是相对比较容易复发，这样的卵巢囊肿只要是卵巢还存在分泌雌激素的功能，还是在周期性的分泌雌激素，那就可能复发。预防复发就是要抑制雌激素的作用，可以用各种激素类的药物做治疗，但是也就会抑制短时间内怀孕的功能。