导致嘴巴两边有疮的因素有很多，治疗方式也不同。

首先，如果是由于上火导致的嘴巴两边有疮，可以在医生指导下口服清热泻火的药物进行治疗，如清火栀麦片、牛黄解毒丸、金银花颗粒等。同时注意饮食要清淡、温凉，不要再吃辛辣刺激、发物等容易上火的食物。

其次，如果是由于感染引起的，可以在医生指导下使用红霉素、金霉素软膏等药物局部涂抹，从而缓解症状。

此外，平时不注意口腔卫生也会出现嘴巴两侧生疮的现象，建议做好口腔卫生和护理，最好早晚各刷一次牙齿，保持口腔清洁。