卵巢巧克力囊肿有的是会引起腰疼的。体积比较大的卵巢巧克力囊肿，也是会对周围组织造成一定的压迫症状。有的会增加盆腔的压力，也有的是会导致腹部下坠感觉、腹胀的感觉、腰酸、腰疼的感觉等。

但是一般来说，体积比较小的卵巢巧克力囊肿是基本没有症状的。有腰疼的症状也要看具体的位置，必要时也是要做外科的检查。比如腰椎检查，也有的会有腰椎问题或者腰肌劳损的问题等。

卵巢巧克力囊肿体积比较大的情况，或者是已经发生了扭转等问题，也是需要做手术治疗的。