男性自慰后尿道刺痛的原因如下：

首先，可能是由于自慰时力度比较大，或者动作比较粗暴，对尿道口周围的组织造成了损伤，致使局部出现了肿胀、疼痛等不适。特别是排尿时受到尿液的冲击力，疼痛会加重，会感觉非常刺痛。

其次，可能是因为经常自慰，但是并不注意卫生导致。男性的尿道口与生殖器官非常相近，如果手上细菌比较多，自慰的同时细菌也很容易引起尿道口的感染，从而患上泌尿系统炎症，会有尿频、尿痛的症状。

经常自慰对男性的健康有伤害，会引起性功能障碍，还会增加感染以及损伤的概率。自慰后出现刺痛的现象，需要及时明确病因并治疗。