怀孕有褐色分泌物，可能是先兆流产、阴道炎等因素导致的。

怀孕后有很多孕妇可能会出现先兆流产的情况，会导致阴道内出现褐色分泌物，一般会出现阵发性腹部疼痛。应当就医进行详细的超声检查，明确妊娠囊的具体部位以及确定胚胎是否存活。如果胚胎存活，应进行相应的保胎治疗。

如果怀孕后女性出现阴道炎，并且阴道炎比较严重，也会导致阴道内流出褐色分泌物，并且会存在阴道瘙痒等症状，在确诊后应进行抗感染治疗。