对于生殖器疱疹和霉菌性龟头炎虽然两者都是性传播性疾病，但是两者之间的差异性还是很明显的，容易相鉴别诊断。

生殖器疱疹是由于感染的单纯疱疹病毒二型而引起的病毒性的皮肤病，通常是在局部皮肤出现片状银屑红斑，上面有密密麻麻的小米粒大小的水泡，有时候疱壁可以出现破溃糜烂的情况，通常是有明显的灼热感和瘙痒感的。

而霉菌性龟头炎主要是由于真菌感染所引起的，通常是在龟头部位出现片状的红斑，上面可以出现白色的、污垢一样的分泌物，需要实验室检查，以进一步明确，局部取材做真菌方面的镜检，如果检查结果是阳性的，则予诊断。