儿童做头部CT的危害主要是指CT对人体的辐射作用，但是实际上现在随着技术发展得越来越好，CT机器扫描的时间越来越短，对人体的辐射量也越来越小了，所以正常人做一次CT是没有什么太大影响的，患者不必要太担心。

而且CT有它的独特性，它对密度的分辨率比较高，所以对于一些外伤的病变或者是头部的出血性病变，都有着独特的诊断价值，是其他的影像学检查方法无法替代的。

如果可以医生也会考虑到儿童这个特殊的群体，尽量为其选择没有辐射性的核磁共振来检查。但是，如果医生选择了头部CT检查，就说明患者的病情适合做头部的CT，遵照医嘱就可以了。