肛门尖锐湿疣主要通过以下几方面来检查：

1.病理组织学检查

2.醋酸白试验：以5%的醋酸溶液涂于会阴及肛门周围皮肤，3～5分钟后即可在HPV感染区域出现光泽、均匀一致、界限清楚的变白区，用放大镜观察更为明显。但局部若有炎症，也可发白而出现假阳性。

3.梅毒血清检查：尖锐湿疣为阴性，扁平湿疣则呈阳性，可供鉴别。

4.阴道内镜检查

5.肛门直肠镜检查：齿线上下和直肠末端，可见淡红色乳头状或菜花状柔软赘生物，质脆，触之易出血。