肺部真菌感染是可以治疗的，但治疗时间相对较长。肺部真菌感染有时候可以是支气管念珠菌病，主要是因为念珠菌而导致的，对于这种疾病可以选用伊曲康唑进行治疗。如果是非白色念珠菌感染导致的，则可以选用伏立康唑作为治疗药物。治疗有效的标准是症状消失，痰标本真菌检查持续两次阴性。肺部真菌感染叫做肺曲霉病，需要通过手术切除加以治疗，然后使用抗曲霉药物进行全身治疗，不过疗效不能肯定。肺隐球菌病多数是没有症状表现，可以通过口服氟康唑进行治疗，一般3到6个月左右疾病就能康复。