儿童长期功能性便秘的危害有：

1.长期的功能性便秘很容易导致肠道菌群失调、腹胀、注意力不集中、营养不良、心急气躁、消瘦、免疫力下降、生长迟缓等症状。

2.长时间的功能便秘，在解大便时大便会比较费劲，也很容易导致痔疮、肛裂。

3.儿童在解大便的时候会非常困难，就会长时间憋着大便形成恶性循环，导致大便越来越干燥，排便越来越困难。

儿童出现功能性便秘后，一定要尽早去医院进行检查大便常规，排除器质性病变，建议通过口服药物或者改善饮食结构来治疗便秘。