月经第12天有褐色血可能是由以下几种原因导致的：

1.月经不调。患有月经不调的女性，月经期往往会出现延迟的现象，因此，阴道内会分泌出褐色的分泌物，如果不及时治疗，会严重影响正常的生理规律，无法明确正常的排卵期，对生育功能造成一定的影响，而且长时间的流血，还有可能使患者出现贫血的现象。

2.排卵期出血。月经第12天正处于排卵期，卵子成熟排出时，有些女性的子宫内膜会出现脱落的现象，进而导致阴道流血，但是出血量相对比较少，2天左右就能够停止，一般不需要进行特殊的治疗。如果出现了明显的不适或者出血量比较多，需要引起重视，及时进行检查，以免发生不必要的损害。

3.妇科疾病。特别是患有宫颈息肉、子宫内膜炎、阴道炎的女性，由于局部长时间受到炎症的刺激，容易出现阴道出血的现象，如果不及时治疗，还有可能会发生其他的并发症，进而影响正常的生活。