肾囊肿有先天性囊肿和后天获得性囊肿。

先天性囊肿为遗传性疾病，除伴有肾囊肿，还伴有肝囊肿，疾病无根治办法，随年龄增长会终身进展。

后天性囊肿大多是因为后天性因素，如感染、结石、免疫等因素导致肾小管闭锁，此时单个或者多个肾小球内产生的尿液，不能通过肾小管排出体外，出现单个或多个肾小球囊内积液，并随时间增长逐渐增大，形成大小不等的囊肿。早期无症状，后期可能出现压迫性症状，如疼痛、腰痛等。