确诊生殖器官上长了水疱，要积极配合医生进行治疗。这种水疱多半通过对症药物就可以治疗，常见原因为生殖器疱疹。

确诊得了生殖器疱疹的男生，此病主要因为单纯疱疹病毒感染造成。在治疗过程中，需结合个体差异，选择用药。对于已经出现明显瘙痒症状者，为了减少水疱出现，加速病情愈合，需要服用阿昔洛韦、伐昔洛韦等药物，进行抗病毒治疗。为了缓解瘙痒感，局部可以用3%的硼酸液进行湿敷。已经继发细菌感染者，就需要使用对症的抗菌药。

具体用药情况，需要去医院经过详细会诊后，听从医生指导。