子宫内膜异位症有恶性的，大多数子宫内膜异位症为良性疾病。

但是如果没有得到及时有效治疗，也有可能会出现恶变可能，子宫内膜异位症病程愈长发生恶变的几率越高，并且在长期的高水平雌激素作用下，也可能会发生子宫内膜恶变，或者是长期服用治疗子宫内膜异位症的药物，也可能会引起卵巢癌的发生，所以子宫内膜异位症有恶性的。

确诊有子宫内膜异位症后，要选择合适方案积极治疗，可以遵医嘱服用避孕药或是带曼月乐环改善症状，也可以通过手术方法治疗，治疗后要选择假绝经的药物治疗效果更好。