患有先天性甲状腺功能减退的婴儿，出生时没有任何症状。可能它们包括以下症状，如运动少、运动慢、嗜睡，与其他婴儿相比，经常需要醒来哺乳和嘶哑哭泣，吸引力差、食物摄入量少、进食困难、便秘、体温降低、黄疸消退延迟、身体变得很细小、皮肤摸上去会觉得干燥粗糙、大舌头等外观异常的症状。

当然这些情况是可以直接观察出来的，但最重要的就是患有此病的患儿，基本上智力很低下，随着年龄增大，患者的智力基本上也是停留在几岁的水平。