造成身高矮小的原因有：

1.基因。这个是影响身高的主要原因，这个是先天性的原因，如果父母身高都比较矮小的，其后代一般个子也不会太高。

2.后天因素。出生后如果出现营养不良、缺钙等情况，尤其是在青春期等身高增长最快的时期，发生营养不良，会严重影响身高。另外平时不注意体育运动，也会导致身高增长缓慢。

3.病理性原因。患者在幼年出现甲状腺功能低下、生长激素缺乏、性早熟导致骨骼过早闭合等情况，也可以导致身材矮小。