阴茎上长的小肉疙瘩，主要考虑有以下问题：

比较常见的就是皮脂腺囊肿，这种疾病口服药没有作用，只有进行手术的治疗，再有就是一些尖锐湿疣，尖锐湿疣是一种性传播性的疾病，发生这种疾病可以先进行抗病毒的治疗，如果症状持续的加重，还可以考虑进行激光或者冷冻的方法以辅助治疗。

再有就是一些炎症，炎症可以刺激肉芽肿的增生，这时候想要治疗，可以进行药物治疗，但是由于炎症有的是真菌或者是细菌引起，方法也是不同的，可以先进行局部的检查，如果有细菌只用抗生素就行，真菌直接给予真菌药物治疗。