磁共振是检查脑部最佳影像学方法。脑的核磁共振可以用于脑部各种病变的检查，尤其是适用于发病率高的脑梗死、脑出血的诊断。脑磁共振还用于脑内感染性病变、脑部肿瘤、脱髓鞘疾病、先天发育畸形等的诊断。脑核磁共振成像原理是基于病灶和正常组织的信号不同而显象。其中磁共振的弥散成像，能够将新发的脑梗和陈旧的脑梗区分开。其中磁共振血管成像，可进一步诊断脑血管畸形，脑动脉瘤以及脑动脉狭窄、闭塞等疾病。但是磁共振对显示钙化性的病变，有一定的局限，比如少突胶质细胞瘤、寄生虫钙化。