卵巢囊肿绝大部分不会影响卵巢功能。因为囊肿的部位发生病变，但是其他卵巢组织仍然会周期性地分泌雌激素和孕激素，所以不会影响卵巢功能。

但是如果女性随着年龄的增长，刚好是在围绝经期的时候发现有卵巢囊肿的现象，这个时候做卵巢功能检查往往会发现卵巢功能出现了相应的下降，这是生理原因所导致。因为女性一生当中大约排四百个卵，所以大约从来月经开始历经三十年左右的时候，会使卵巢功能出现下降，所以跟卵巢囊肿基本上关系不大。

建议一旦发现有卵巢囊肿，要根据具体的情况采取保守治疗，还是采取手术治疗。主要是根据囊肿的大小、根据相应的临床症状给予决定。