核磁共振检查和CT都是影像科不同种类的检查项目，区别主要成像原理不同，CT通过X线进行投照，核磁共振检查通过电磁波切割磁力线产生。CT只有一种图像，分辨率不高。

而核磁共振成像通过很多序列对同一位置进行扫描，得出不同图像、分辨率高。CT优势速度快，可以作为急诊检查项目，快速发现脑出血等危及生命的疾病。而核磁共振检查扫描慢，要求太高，有心脏起搏器、支架、钢钉钢板等患者还做不了核磁共振检查，所以很多限制条件无法作为急诊检查项目。

CT和核磁共振检查根据临床症状不同，临床医生考虑疾病不同而建议做不同的检查项目。