在进行咽拭子检查的时候，通常并不会有严重的难受的感觉出现。因为一方面，咽拭子检查的时间非常短，操作也非常快，所以并不会导致患者严重的身体不适。

另外一方面，咽拭子检查的操作步骤，主要是通过使用干净的棉签收集患者咽喉部位的分泌物来实现，患者如果可以放松心情，良好的配合医生的操作，不会有明显的感觉。

因此，当患者需要进行痰液培养检查，或者是病毒培养等需要进行咽拭子检查的时候，应当遵守医嘱，根据医生的指导进行操作，积极配合检查才有利于确定病因。