治疗畸形性骨炎的药物如下：

1.磷酸盐类的药物，比如帕米磷酸盐，但是此类的药物具有一定的副作用。如果患者无法耐受，可以使用降钙素代替治疗，能参与钙调节，改善畸形性骨炎所引起的不适症状。

2.止痛药物，疼痛比较严重时，患者还可使用非甾体抗炎类药物予以缓解，比如双氯芬酸钠、塞来昔布等。

对于重度的畸形性骨炎，使用药物无法进行有效控制时，应当考虑进行手术治疗，比如关节置换术。在治疗期间，患者应当补充钙质以及维生素D，避免摔倒。