畸形性骨炎的病变部位如果处于腿部，可能会导致骨骼增大与畸形，会导致局部的压力增大，容易引起骨关节炎。

若是颅骨部位出现病变，可能会对听力造成影响，导致耳鸣或者是听力完全丧失。如果是全身性的畸形性骨炎，还容易引起心力衰竭，主要是由于心脏需要超负荷泵血，才能够将血液输送到病变部位，因此就容易出现心力衰竭。有极少数的畸形性骨炎，还会引起恶性骨肿瘤。

由此可见，畸形性骨炎的并发症比较严重，应尽早的进行治疗，避免出现这些严重的并发症。