预防甲型流感的最重要的公共卫生措施是应用流感病毒减活疫苗。疫苗的组成，每年应有变化，取决于当前流行的病毒和既往的变异情况。近15年来，流感病毒疫苗主要包括H1N1、H3N2和B抗原。

流感病毒疫苗推荐应用于以下人群：6个月以上的任何人，具有流感并发症的高度危险性者，卫生工作人员和护理人员，与高危人群有密切接触者，希望减少患流感发病机会的任何人群。

通常，每年儿童在一个月内应分开2次接种流感疫苗，而成人每年只需接种一次。如果流行的病毒与疫苗相匹配时，65岁以下的健康人群中，流感疫苗的预防率可达75%。在老年人中接种流感疫苗后，因流感和肺炎而住院的比例可下降30%至70%。