新生儿面横裂和耳畸形的发病原因不清楚，多于胚胎发育三个月内受到外界环境的不良影响，例如病毒感染、环境污染、放射性污染、单用药物等原因，胎儿生长发育受到刺激而出现的基因突变。

在耳廓的发育阶段，胚胎受到遗传或外界因素的影响，会出现耳廓的多种发育畸形。所以为了防止畸形发生，平时远离污染，注意开窗通风，打扫房间卫生，不要使用不良装修，以免影响身体健康，导致畸形的发生。避免乱使用药物。