新生儿有耳部畸形的具体病因目前并非十分明确，但大多学者认为和遗传因素以及环境的共同作用结果有关。

这种胚胎时期因胎儿发育异常而导致的先天性疾病，主要诱因和女性怀孕期间有病毒感染、重型感冒、服用药物不当，还有吸入一些有毒、有害的特殊气体，均可导致在发育期使胎儿出现畸形发育。

而且这种新生儿耳部畸形，也分为外耳道畸形、中耳畸形以及内耳畸形。此病严重时会造成听力下降及损失，甚至全聋。所以需要去医院进行详细的耳部检查，确定畸形的严重程度，并要适龄时期择期及早进行手术为宜。