菌阴肺结核也可能出现严重的情况。菌阴肺结核是指肺结核患者的痰中不会排放有结核分枝杆菌，这样的患者不是开放性肺结核，传染性较低。

但是如果患者结核病分期较晚，也可能出现严重的情况，如出现血行播散型的肺结核，属于重症肺结核。患者会出现严重毒血症状，如反复高热，这时患者肺结核就属于严重的情况。

患者如果属于慢性纤维空洞型肺结核，结核病分期较晚，多由于没有经过有效规律足疗程的抗结核治疗，已经进入肺毁损阶段，患者即使痰菌阴性，结核病也是很严重的。