肛瘘的手术方式主要有以下几种：

第一，肛瘘切开术，适用于低位肛瘘，主要是将肛瘘瘘管完全切开，清除瘘管内坏死组织。

第二，肛瘘切除术，适用于纤维化非常明显的肛瘘，将整根瘘管以及周围瘢痕组织一并切除。

第三，肛瘘挂线术，适用于高位肛瘘的治疗，高位肛瘘如果将瘘管一次性切开，会导致肛直环受到很大的损伤，引起术后肛门失禁，所以采取挂线术。

第四，LIFT术，手术时通过肛门内外括约肌间隙进入瘘管处，将瘘管切断结扎，这种手术方式对肛门括约肌损伤小。

以上的手术方式属于肛瘘的经典手术方式，也是常用手术方式。另外，还包括肛瘘镜手术以及生物制剂填塞、封堵等等。