基底凹陷症如果早期经过手术治疗，大部分能够康复，不会复发。

本病是一种颅部和颈部交界区的发育畸形，是由于怀孕期母亲用药不当或感染因素，引起的胚胎发育障碍有关的疾病。由于脑干和脊髓受到压迫而出现四肢运动障碍、感觉障碍。如果得不到很好的治疗，大多数患者会逐渐的发展为四肢瘫痪、残疾甚至许多患者出现夭折。

建议如果早期发现基底凹陷的症状，应尽早的前往医院接受手术治疗，术后应积极进行康复治疗，大多数患者会恢复正常，开始新的生活。