男人小便后有疼痛感的治疗方法如下：

1.若是尿道轻度损伤所引起的小便疼痛感，一般不需要进行特殊处理，应多休息，清淡饮食。如果疼痛的症状比较明显，可使用消炎镇痛类的药物予以缓解，通常在3~5天左右能够恢复正常。

2.对于感染因素所引起的排尿疼痛，比如尿路感染或者是性病感染，在确诊以后都应进行相应的抗感染治疗。比如左氧氟沙星、环丙沙星、阿奇霉素等，一定要足量、足疗程用药。

3.如果是尿路结石所导致的排尿疼痛，主要是根据结石的大小进行针对性排石治疗，比如药物排石或者是体外冲击波碎石。