睡醒两个耳朵肿了有以下的情况：

1.耳廓假性囊肿。这种好发于成年男性，表现为耳廓表面半球形的隆起，界限清楚，表皮颜色正常，有波动感，按压没有疼痛感，主要是无菌性的炎症，这种疾病临床上大多数需要进行手术处理。

2.有可能与局部有蚊虫等叮咬诱发导致的过敏中毒反应有关系，这种好发于婴幼儿。

3.临床上有可能是耳廓化脓性软骨膜炎。这种可以出现耳朵的红肿热痛，甚至出现局部脓肿，临床上需要加大抗生素治疗。