咽后脓肿和急性上呼吸道感染的区别主要有下列几点：

1.发病的疾病阶段不同。咽后脓肿多数是发生在急性上呼吸道感染之后。急性上呼吸道感染并不一定会有脓肿形成，可能仅表现为感染部位的红肿或充血等现象，但感染严重之后，可能会逐渐形成脓肿。

2.疾病的临床表现不同。急性上呼吸道感染种类比较多，范围也比较广，可能会出现打喷嚏、流鼻涕、鼻塞、咽喉疼痛、声音嘶哑等各种异常症状。但是咽后脓肿则主要表现为呼吸不畅、呛咳、喘鸣等表现。