肛瘘需要行肛肠科的专科查体，以及肛门镜检查。复杂性的肛瘘，可能还需要进行肛周软组织的彩超检查。

肛瘘是肛门软组织慢性化脓性疾病，通常继发于肛周脓肿或者肛门穿透伤之后，是由内溃口、皮下瘘管以及外溃口组成的，可以引起肛门反复的肿痛、破溃、流脓，手术是唯一可以治愈的治疗方式。

肛瘘的确诊，首先要经过肛肠科专科的查体，以及肛门镜检查。复杂性的肛瘘可有多个外溃口，皮下的瘘管可能错综复杂，需要进行肛周软组织彩超检查，并用亚甲蓝标记皮下瘘管的走向，作为手术时参考，提高手术成功率。