肛瘘一般并不需要做电子肠镜的检查。

肛瘘常用的检查方法是瘘管造影、磁共振检查以及腔内超声等，这些检查的目的主要是了解肛瘘瘘管的走行、数量以及位置，可以提高手术的成功率，降低手术的复发率。

但是在临床上，对于一些怀疑有特殊感染引起的特殊类型的肛瘘，必要时需要行肠镜检查。例如结核杆菌感染引发的结核性肛瘘，以及克罗恩病引发的肛瘘，这两种疾病所引发的肛瘘需要先通过治疗控制原发疾病的症状，症状控制后再行肛瘘手术治疗，不然会导致术后切口愈合不良，甚至不愈合。