孕期出现流黑色淤血的情况，是不会导致胎儿畸形的，但是流黑色淤血要考虑是不是有先兆流产或者是宫外孕的问题。需要去医院进行相应的检查，如果是宫外孕的，需要采取相应的治疗措施及时终止妊娠。

如果是先兆流产，可以根据具体的情况先进行保胎治疗，如果经过保胎治疗流血停止，胎儿继续生长发育说明治疗是有效果的。如果保胎治疗效果不好，流血的情况加重，胎儿很有可能就保不住。

这种情况有可能就是胎儿本身就有问题，就有可能存在畸形的情况，但是这种不是因为有黑色淤血导致的胎儿畸形。而是因为胎儿有畸形不能存活，发生了流产导致的黑色淤血。