脑型疟疾常用的治疗药物主要有氯喹、磷酸哌喹、盐酸阿莫地喹、青蒿素、奎宁等。其中氯喹的毒性比较小，具有安全吸收快的特性，不过有一定的副作用，比如可导致患者血压下降、恶心、以及头晕等症状，对于产生抗药性的恶性疟原虫可采取青蒿素、甲氯喹或者进行联合用药治疗。

脑型疟疾能够严重的引发人体中枢神经系统的感染，常导致患者出现厌食、畏寒、发热、脾大、深度昏迷、烦躁不安、惊厥、颈项强直、休克等症状，也是导致死亡的关键因素。

因此如果感染脑型疟疾必须及早发现、及早进行治疗。