脑型疟疾可以导致患者发生多种后遗症。

比如有些患者体内的疟原虫可以堵塞患者的脑血管，使患者发生脑栓塞，脑栓塞后脑细胞会坏死，患者可以表现为偏瘫的症状，导致患者出现行动不便的后遗症，有些患者还可以伴有吞咽困难的症状。

脑型疟疾还可以导致脑细胞出现损伤，患者可以表现为癫痫的症状。有些患者的脑细胞损伤后还可以导致患者出现言语不利的症状。部分脑型疟疾的患者病情较严重，甚至可以出现呼吸衰竭导致患者发生死亡。