半夜腹部痛醒的原因如下：

考虑是消化道溃疡，尤以十二指肠溃疡最为常见，因为此病往往是夜间空腹饥饿的时候，由于胃酸刺激肠黏膜就会引发疼痛。部位一般位于上腹部胸骨下方，持续性烧灼样的疼痛，严重的时候会出现恶心、呕吐，出现并发症会出现呕血黑便。患者一般进食之后，或者口服抑酸剂之后疼痛就会缓解。疼痛可以反复发作，多发生在秋冬或者冬春之交。

此外，也不能排除急性胰腺炎，胆囊结石胆囊炎等疾病，应该到医院检查，明确病因。