小肚子总是隐隐作痛，要先考虑是肠道疾病引起，比如结肠炎、十二指肠溃疡、肠痉挛、肠梗阻等问题。

如果是女性肚子隐痛，要考虑是不是经期快到，也有可能是盆腔炎、附件炎、卵巢囊肿、子宫腺肌症等疾病的可能性。但是此类疾病除了小腹隐痛，通常还会伴随白带异常、月经紊乱的症状。

如果是男性小肚子隐痛，要考虑是不是前列腺炎、泌尿系统感染等疾病引起，但是此类疾病一般还会伴随尿频、尿急等不适症状。