眼睛麻痹性偏头痛是一种以反复发作性的眼外肌麻痹和偏头痛为特征的与神经系统有关，原发于眼部的综合症，主要采用药物治疗。常用的药物有血管扩张剂，大剂量维生素以及皮质类固醇。

可以全身应用复方丹参、维脑路通等血管扩张剂，再全身用大剂量维生素b族，激素应用可以减轻炎性水肿。

如果合并鼻窦炎则需要应用抗生素作为辅助治疗，对精神紧张的可以服用小剂量镇静剂。一般综合治疗后的一周内，症状可以消失，眼肌麻痹在两个月内逐渐恢复。