宝宝囟门凹陷可能的原因有脱水、营养不良、降颅压治疗。

1.脱水。如果宝宝腹泻、呕吐次数比较频繁，体液丢失比较多，不及时补充水分会造成宝宝脱水。大脑的组织液、脑脊液也会相应地减少，从而引起囟门凹陷，这是最常见的原因。

2.营养不良。正常情况下宝宝囟门处是饱满的，而且大多会在一周岁左右的时间闭合，但是如果喂养不当，导致营养不均衡，甚至营养不良，宝宝生长发育缓慢，可能会引起宝宝囟门凹陷、延迟闭合。

3.降颅压治疗。如果宝宝患颅内压增高的疾病，医生在治疗时会使用药物进行降颅压治疗，减少脑脊液的量从而降低颅内压，会引起宝宝囟门凹陷。