怀孕有囊肿是否会影响胎儿，主要与囊肿的性质有关。

如果为生理性囊肿，一般不会对胎儿的发育造成影响，通常在怀孕12周左右囊肿可逐渐自行消失。如果为病理性囊肿且囊肿较大，生长的速度又比较快，则可能会对胎儿造成较大影响，对于孕妇也有一定的危害。可能会发生蒂扭转进而引起急腹症，也可能会在孕妇分娩时，因囊肿影响胎头下降造成难产。

因此针对怀孕囊肿，首先明确囊肿的性质，其次要遵医嘱定期随访、复查。如果出现了蒂扭转的情况，建议及时进行手术治疗。