妊娠合并症可能会导致胎儿畸形，但不是绝对的。妊娠合并症有很多种，如高血压、心脏疾病或是糖尿病、肾病、甲状腺疾病等。

比如患有妊娠期糖尿病可能会导致胎儿发育过快，形成巨大儿。而妊娠期甲状腺疾病或者是高血压会导致胎盘供应不足，影响胎儿发育，出现胎儿发育迟缓、生长发育受限等情况，容易增加畸形率。

妊娠合并症对孕妇和胎儿都会有很大危害，孕期要注意定期产检，做到预防、早发现、早治疗为主。如果有妊娠合并症情况要根据孕妇和胎儿情况综合治疗。